Descrizione

Alla scoperta della Bioinformatica: una proteina nella rete

L’era genomica ha assistito ad una crescita esponenziale delle informazioni biologiche rese disponibili dai progressi nel campo della biologia molecolare. In particolare, il sequenziamento del genoma umano e di altri organismi ha dato un forte impulso a quel settore della biologia che si occupa dello studio del DNA e delle proteine. La grande sfida che la comunità scientifica sta ora affrontando consiste nel cercare di analizzare e capire l’enorme quantità di dati prodotta in laboratorio.

La bioinformatica e’ una nuova disciplina che si occupa dello sviluppo e dell’integrazione tra la ricerca scientifica in campo biologico (bio-) e le applicazioni della scienza dell’ informazione (-informatica).

Una delle attività principali dei bioinformatici consiste nella progettazione, costruzione e uso di banche dati di interesse biologico. Questo tipo di banche dati raccoglie dati e informazioni derivati da esperimenti di laboratorio, da esperimenti in silico (cioè l’utilizzo di analisi informatiche che producono dati che possono essere usati come punto di partenza per gli esperimenti in vitro. Si dice “in silico“, in quanto i processori dei calcolatori sono costituiti da silicio) e dalla letteratura scientifica.

Nel corso dell’attività pratica, organizzata sotto forma di caccia al tesoro, verrà proposto un percorso sulle tracce della proteina Pax6 attraverso alcune delle principali banche dati disponibili in rete. Scopriremo quante e quali informazioni è possibile ricavare partendo da una sequenza o da un nome grazie un semplice computer connesso in rete.

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